在孕中期，醫生通常會進行一系列的產前篩查測試，以檢測胎兒中各種不同的染色體和先天性疾病。 篩查的條件在預後上可能會有很大差異。 患有這些疾病中的某些疾病，如唐氏綜合徵和輕度至中度神經管缺陷的兒童可以活著出生並且過正常的壽命 - 雖然他們可能患有發育障礙，身體障礙或認知障礙。
在產前篩查中檢測到的其他病症可能是致命的或攜帶嚴重不良的預後。 例如，一半出生於無腦的嬰兒將無法生存，另一半則會在幾小時或幾天內死亡。 染色體狀況如13三體或18三體可導致嬰兒壽命短; 90％有這些情況的嬰兒在一歲以前都不能存活，並且在他們的一生中經常受到健康問題和醫療干預的困擾。
醫學上指示的終止
當產前篩查和隨後的診斷測試返回確定性預後不良的情況下，父母可能會面臨是否繼續懷孕的決定。 在這些情況下終止妊娠有時被稱為基於醫療或醫學指示的終止。 如果她繼續懷孕，罕見懷孕或其他健康並發症對母親的生活構成明顯威脅，那麼父母也可能最終考慮採取基於醫療的終止。
當父母因為嬰兒的嚴重醫療狀況而選擇終止妊娠時，醫療過程在技術上就是第二孕期流產或“晚期”流產 - 並且它在技術上是選擇性的，因為父母可以選擇是否讓自然接受當然或結束懷孕。
然而，與大多數選擇性終止相反，由於醫療原因，大多數嬰兒在懷孕後期中止是非常受歡迎的，父母可能會對寶寶的喪失深感悲痛。
政治和情緒
任何類型的懷孕終止往往是個人和政治上的分裂和情緒問題。 在哲學上或宗教上反對墮胎的人可能會認為所有墮胎都是錯的 - 不管情況如何。 活動家團體有時甚至深深反對醫療終止，許多在線網站都會說明每個嬰兒都應該被定罪。 有選擇性立場的人通常不會反對以醫療為基礎的終止。
如果診斷的病情不一定是致命的，那麼在產前診斷後選擇性流產的一些反對者擔心父母可能無法獲得全部信息。 多年來，由於唐氏綜合徵等條件的影響，結果有所改善，他們擔心父母可能會收到關於撫養患有身體或發育障礙的兒童是什麼樣的不准確和令人沮喪的看法。
在政治背景之外，在這些情況下更重要的是父母的感受。
父母的情感往往落在一個頻譜的某個位置，而不是黑白分明（正如政治觀點一樣）。 即使診斷出致命的先天性缺陷，有些人也無法理解是否有過晚期流產的想法，而其他人則與這一想法搏鬥，但最終選擇終止，而其他人即使他們悲傷也沒有與決定鬥爭寶寶的損失。 在所有情況下，對父母來說這是一個非常艱難的決定，而且往往伴隨著重大的悲傷和悲傷。
決定有利於醫學證明的墮胎
當父母決定因醫療原因而終止時，這個決定可能有很多因素。
在非致命的情況下，父母可能會覺得自己沒有能力處理一個終身有特殊需求的孩子。 有時終止決定涉及對嬰兒痛苦的關注。 例如，在像18三體這樣的情況下，可能存在嚴重的醫療問題以及很短的預期壽命，父母可能希望在沒有希望得到好的結果時避免讓孩子受到不必要的疼痛。 這些父母可能會覺得終止是兩個惡魔中較小的一個。
終止醫療適應症也可能涉及母親的情緒健康問題。 當收到醫療診斷的消息時，母親可能不想面對額外的幾個月的懷孕，只能看到他們想要的寶寶在醫院裡死亡。 這些母親可能需要結束身體過程，以便他們能夠以對自己和家人最好的方式開始悲傷和治療。
最後，有些情況可能對母親的生活造成嚴重的風險，例如雙胎妊娠的罕見情況涉及一個正常胎兒和一個葡萄胎 （其中母親最終面臨發展惡性妊娠滋養細胞疾病的風險的60％如果她選擇繼續懷孕）。 在這些情況下，母親的生命和健康可能受到終止的保護 - 即使寶寶非常想要。
決定禁止醫學上的墮胎
對於非致命疾病（如唐氏綜合症）的診斷，父母可以決定他們已經準備好並願意接受有特殊需求的兒童。 即使嬰兒或母親的預後很差，在一些情況下，由於宗教信仰或對墮胎的深刻哲學信念，一些父母可能會選擇不予終止。
儘管如此，其他父母可能會感到安慰，讓自然走上正軌，並有機會在嬰兒消失之前抱住嬰兒，也許無法承受終止嬰兒生命的想法。
少數父母可能會繼續懷孕，因為希望診斷錯誤，並且一切都會好轉。 （診斷錯誤對於那些會引發醫學終止問題的病例極為罕見;例如，通過羊膜穿刺術獲得的染色體研究，除了極少數的實驗室錯誤外，其準確率達到100％。）
個人和個人決定
決定是否終止受嚴重醫療狀況影響的懷孕非常個人化。 有些父母採取中間立場，如果情況是出生時或之後不久就會導致死亡，但選擇繼續懷孕，讓寶寶有生理或發育狀況，但也有合理的預期壽命，則選擇終止妊娠。
有些州確實有書上的法律，如果病情不會威脅到母親的生活，可能會使終止困難，在這種情況下，婦女可能會被迫長途跋涉或繼續懷孕。
由於醫學原因，孕中期終止通常涉及D＆E （擴張和撤離）或D＆X（擴張和提取）程序 - 通常預先註射以阻止嬰兒的心跳。 D＆X程序用於其中一些終端，具有很高的爭議性。 立法者針對這一程序，有時被保守媒體稱為“部分出生墮胎”，近年來，程序的未來仍不確定。
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